این دانشگاه در شهر فاماگوستا در شرق جزیره قبرس قراردارد و دارای ۱۲ دانشکده است و هرکدام از آن‌ها برنامه‌های بسیاری را در مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکترا به زبان‌های انگلیسی و ترکی ارائه می‌دهند. دانشکده‌های دانشگاه مدیترانه شرقی عبارت‌اند از:
دانشکده معماری
دانشکده هنر و علوم
دانشکده مدیریت و اقتصاد
دانشکده ارتباطات و علوم رسانه
دانشکده دندانپزشکی
دانشکده آموزش‌وپرورش
دانشکده مهندسی
دانشکده علوم بهداشتی
دانشکده حقوق
دانشکده پزشکی
دانشکده داروسازی
دانشکده گردشگری
دانشگاه علوم پزشکی ایران یکی از دانشگاه‌های همکار دانشگاه مدیترانه شرقی محسوب می‌شود. این دانشگاه برنامه‌های دکتری حرفه‌ای دندانپزشکی و پزشکی را با کمک دانشگاه ایران برگزار می‌کند. دانشجویان معمولاً سال‌های اول تحصیل خود را در دانشگاه مدیترانه شرقی گذرانده و سپس سال‌های باقیمانده را در دانشگاه علوم پزشکی ایران خواهند گذراند. شایان‌ذکر است که زبان تحصیل این برنامه انگلیسی است.
دانشجویان خارجی که وارد دوره پزشکی مشترک با دانشگاه علوم پزشکی ایران می‌شوند فرصت آموختن زبان فارسی جهت ارتباط با بیماران در مراکز درمانی تهران را خواهند داشت. مرحله آموزش کلینیکی در دانشگاه علوم پزشکی ایران در ۱۷ بیمارستان و مرکز درمانی شهر تهران انجام می‌گیرد.
